支线情节：
（1）在咸阳集市入口见到神秘徒儿凯凯（神秘乞丐的对面），花6000钱得到法宝消费符。
（2）帮全全找到捉迷藏的玩伴，得到御风疾行符。

主线：
三人刚走出客栈，意外的在门口遇到了以前墨家的同门彭渊和匡襄，他们原来是被派往楚地协助抗秦，因为畏惧秦军机关部队威力太大所以偷偷脱离了墨门隐居。现在知道秦军机关部队正在大肆进攻墨家大寨，而且数量多得足以歼灭1个国家，墨家眼看便要灭亡，众弟子都在回援，他们也准备与墨门共存亡。但如此回去显然是白白送死，他们告知下邳东北角的机关山隐居着被逐出门墙的墨门弟子白舆老人，他精于机关技术，希望水镜去找他并得到他的帮助。来到机关山，山腹内果然机关密布，制作精细，特别是最后的机关战屋更是威力强大（此处完成40场战斗后便不再有敌人，不必全部打完，笔者就只打了20来战）。打倒机关战屋后来到白舆谷内见过水鱼民何舅，他是白舆的弟子，为了拜师精研机关术才从水鱼国来到这里。白舆向众人展示能从龙形变成鼎形，拥有神秘黑火力量的周鼎，并表示将周鼎隐藏的力量作为其所制机关战屋的动力，才能将他毕生研习的鲁班机关术发挥到极致。此周鼎共有9个，原是蕴藏神奇力量的金属，被称以黑火，最先一直被放在蜀国太庙内，后来蜀国内乱，辗转传入中原，大禹将金属和九州各牧进贡的青铜一起融合，铸为九鼎，要控制黑火还需要一块特殊的紫晶石。秦军机关术只是以云中界的妖怪作为动力，与以周鼎为动力的鲁班机关术原理大不相同，当年他正是为了探求纹锦严令禁止的黑火之奥秘，私自解读巴蜀古文字，才被逐出墨门。但白舆心中无时无刻不挂念墨门安危，他将机关战屋和一封给纹锦的竹简送给水镜，让他们火速回援墨家大寨，并吩咐让下邳的墨家弟子留守待命（随行的何舅可放入天书，他的炼化能力值很高，能帮助炼化许多宝物）。

现在可以坐机关战屋走路啦，好快好帅。水镜等人回到下邳，从北宫泓处得知墨家大寨现在韩魏地区一处叫神农峡的地方，于是首先到韩魏地区，进去后向左边走就是神农峡。路上遇到一秦军踏弩，利用机关战屋的威力轻松打败了这曾经威风凛凛的家伙。来到墨家大寨，众位师兄因听信白舆传授秦人机关术的谣言，对其和水镜极为愤恨，纹锦详阅白舆的信简后，在墨家危急存亡之秋接受了使用白舆所制机关战屋的建议（要找的三个弟子二个在屋子里，另外一个在对门机关屋旁边），派遣弟子前往机关山学习机关术，这样也能让尽可能多的墨家子弟逃生。弟子中行宪愿意担此不义的恶名，让在场众人深受感动，纹锦随即让水镜等人前往秦都咸阳，寻找剩下的8个周鼎作为白舆机关战屋的动力，否则凭一台机关屋是无法与众多秦军机关部队抗衡的。

来到咸阳城，在城门口遇见姬良昔日刺杀秦皇的帮手力士田角，田角带众人去见仓海君，水镜说明来意，仓海君让众人去拜访原周朝的博士官左忒。来到左宅，左忒竟然是条狗，而左忒本人却冠名以左忒的狗，不禁让人感到秦朝苛政之严酷。左忒的狗得知众人来意后，说出九鼎来由：原来大禹当年治理天下，曾令八方诸侯献纳青铜，铸造象征天下的九鼎，而西南梁州献上的是九个造型特异的金人，它们本是蜀国太庙内所祭祀的神像，自古相传其内蕴含有惊天动地的力量，水镜等人闻言惊叹不已。当夜左忒的狗带领众人来到镐京遗址，从防守薄弱的山背秘道顺利潜入，疾鹏装成铁面大将军骗过了守门的秦军来到存放周鼎的密室，打败看守的狐狸精后姬良召出何舅仿制假鼎，然后把真鼎带走。临走前姬良对墙壁上所刻的文字产生了兴趣，那里记载的是蜀国灭亡的历史。回到机关山，白舆一眼便看出带回的周鼎全都是些假货而已，此时消息传来，墨家大寨已被秦军找到并攻破，白舆令水镜等人驾驶机关战屋救出夫人纹锦。

火速赶到青龙峡，只见到已成废墟的墨家大寨和满地同门的尸体，水镜顿时泪流满面。在大寨左边找到大师兄的遗体，这时候躲过浩劫幸存下来的同门弟子告诉水镜，大寨被攻破后夫人纹锦重伤，被秦军俘去准备五马分尸。水镜决定靠机关战屋的威力，强行闯入秦军营地营救夫人（闯营前再次返回墨家大寨废墟，可得到武器绝情猫袖箭），先在大寨里转几圈，把所有同门的尸体好好掩埋然后（有一个就在出口处，转动地图可以看到），来到秦军驻地，对方机关车巨雷数量实在太多，机关屋的战力以一对二已是极限，十分棘手。好不容易强行冲到大营附近，却陷入重重包围，正危急间秦公子扶苏出现喝止攻击，并与姬良商谈。扶苏知道秦皇听信赤松子之言，迫害墨家，当他得知秦皇把蒙恬将军用来防守北匈奴的机关巨雷部队调来攻打墨门时，急忙前来阻止，结果还是晚了一步。扶苏劝蒙恬放走被俘的夫人纹锦，否则夫人会成为赤松子开启蜀国黑火之源的钥匙，哪知道此刻赤松子的弟子犀衍已经进入秦营，强行带走了纹锦和控制巨雷的所有动力。在知悉夫人可能被带往蜀国太庙遗迹后，众人随即前往蜀地。

一行人先来到蜀地的小村庄骆园（在骆园与小孩对话可买卖物品），从村民口中了解到太庙遗迹下封印的金蛹是妖魔的象征，一旦被再度孵化，世界便会暗无天日。赶到太庙[ALi:PAGE]遗址（地图的西北方向），姬良发现已有人比他们先到了，火速通过巴蜀地底湖泊，这是一个巨大的迷宫，但是并没有太多岔路，凭你的直觉来走吧。又经过一段小路，眼前出现了不可思议的巨大黑茧！进入黑茧内部，里面的建筑更是无法想象，这种文明程度在水镜和姬良看来完全不能接受，水镜等人进入黑茧核心，发现纹锦并没有在这里，壶中仙的弟子犀衍却早已等候多时。他听得师尊壶中仙称赞姬良资质一流，忍不住技痒要考察考察（发生战斗），打败后他说为了不愿水镜等人利用黑火的力量来对抗壶中仙的计划，收走黑蛹离去。水镜眼看救不回纹锦，伤心失望自责之下痛哭起来，姬良却推断出壶中仙、犀衍连同纹锦甚至还有神秘的黑蛹，最有可能就在云中界。

众人回到云中界，向何罗大王询问进入云中界核心云中渊的方法，何罗大王表示他也不清楚。只好先来到云中渊外看看情况，正巧遇到砍头三人组在此打倒了争强好胜的的项羽，他们一番自吹自擂地要去云彩之塔消灭魔王，拯救被奴役的云中界万民，并且用得来的虹石祭出通向云彩之塔的通道，正好方便了姬良等人。众人尾随来到云彩之塔内（超大型迷宫），见60级的砍头三人组已倒在地上，看来怪物很强啊，从他们身上得到残破的竹简后天书功能升级。在云彩之塔第1层见到小壶中仙，他向众人索要贿赂，才肯将众人送到塔的其他层去，于是水镜先在第1层找到一个居所地权就能到第二层（一直向右边走，在一个古幕旁边的箱子里），在第二层击倒守护神阿修罗，救出夫人纹锦后，又找到第2个居所地权。纹锦察觉到第3层有人一直在召唤她，执意要去营救，竟然在小壶中仙处又见到了砍头三人组，真是阴魂不散啊，他们是被多毛国的转生台复活的，因为没有居所地权却执意要上塔反而被小壶中仙传送得不知所往。来到第3层，见室内摆放着除了炼妖壶和轩辕剑外的其它8件上古神器，包括先前犀衍从黑茧取走的神秘金蛹，这时犀衍和壶中仙出现，见众人屡次妨碍其计划，盛怒之下挥手就将众人击倒，但纹锦乘机将金蛹孵化，蛹内的黑袍少年运起黑火力量要杀犀衍，壶中仙出手营救，自己却被黑火击得粉身碎骨。犀衍奋力救走壶中仙，黑袍少年也不支昏倒，而纹锦目光呆滞，似乎心有所想……